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L'area protetta sorge sulla costa del Pacifico, con spiagge, mangrovie e lagune costiere, alle foreste tropicali nella parte superiore del Cerro Tacarcuna, che a 1.845 metri di altitudine è il punto più alto del parco nazionale, situato nella divisione continentale di Serranía. del Darién, a pochi chilometri dai Caraibi, nell'angolo nord-ovest del paese. Tra i due estremi, un'imponente copertura forestale di foreste pluviali tropicali e foreste pluviali molto umide di un grande spartiacque ne definisce il paesaggio.



Le principali catene montuose e le montagne del parco sono di origine vulcanica e si possono ancora vedere i ciuffi e le lave che manifestano il suo passato convulso. La catena montuosa Darién a nord, la catena montuosa Pirre e Setule a sud e la catena montuosa Sapo e la catena montuosa Juradó a sud sono le caratteristiche morfologiche più significative. I fiumi più importanti della regione nascono nel parco, compresi i fiumi Tuira, Balsas, Sambú e Jaque.



Il parco si trova all'estremità orientale del paese, nella provincia di Darien, al confine con il 90% del confine tra Panama e Colombia, e 325 chilometri su strada da Panama City.



Un importante luogo per il birdwatching è il Environmental Center e la Cana Scientific Station, situata nel cuore del parco, in quelle che erano le famose miniere d'oro dell'Espirito Santo o Cana.



Numerosi percorsi storici e naturalistici rimangono aperti tutto l'anno in questa area del parco nazionale gestita dalla National Association for Nature Conservation (ANCON).

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